MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1050

Total Repeats: 624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187142	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187142	GGT	2	6	80	85	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187142	TTTTA	2	10	107	116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187142	AT	3	6	154	159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187142	AAG	2	6	179	184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187142	T	6	6	250	255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187142	A	7	7	257	263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187142	TTGC	2	8	288	295	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NT_187142	ATA	2	6	318	323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187142	TAA	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187142	TAC	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187142	TCT	2	6	376	381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187142	AGAAT	2	10	401	410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187142	AT	3	6	498	503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187142	TA	3	6	545	550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187142	T	7	7	551	557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187142	T	7	7	603	609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187142	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187142	TAA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187142	TTGTA	2	10	808	817	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187142	ATG	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187142	ATTT	2	8	1098	1105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187142	CTT	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187142	TTTG	2	8	1167	1174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187142	ATT	2	6	1209	1214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187142	TC	3	6	1254	1259	0 %	50 %	0 %	50 %	426202359
27	NT_187142	TCA	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202359
28	NT_187142	T	6	6	1382	1387	0 %	100 %	0 %	0 %	426202359
29	NT_187142	ACTTT	2	10	1422	1431	20 %	60 %	0 %	20 %	426202359
30	NT_187142	TTA	2	6	1458	1463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202359
31	NT_187142	TCA	2	6	1464	1469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202359
32	NT_187142	CTTT	2	8	1498	1505	0 %	75 %	0 %	25 %	426202359
33	NT_187142	T	6	6	1546	1551	0 %	100 %	0 %	0 %	426202359
34	NT_187142	TGT	2	6	1562	1567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202359
35	NT_187142	T	7	7	1597	1603	0 %	100 %	0 %	0 %	426202359
36	NT_187142	ACT	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202359
37	NT_187142	TAG	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202359
38	NT_187142	TAA	2	6	1643	1648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202359
39	NT_187142	AAAAT	2	10	1653	1662	80 %	20 %	0 %	0 %	426202359
40	NT_187142	AT	3	6	1713	1718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187142	TGT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187142	TTGTT	2	10	1779	1788	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187142	AAG	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202360
44	NT_187142	TGA	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202360
45	NT_187142	TGT	2	6	1879	1884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202360
46	NT_187142	AGGC	2	8	1897	1904	25 %	0 %	50 %	25 %	426202360
47	NT_187142	GAG	2	6	1976	1981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202360
48	NT_187142	TCAGT	2	10	2101	2110	20 %	40 %	20 %	20 %	426202360
49	NT_187142	GAATT	2	10	2130	2139	40 %	40 %	20 %	0 %	426202360
50	NT_187142	AGA	2	6	2206	2211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202360
51	NT_187142	ATA	2	6	2229	2234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202360
52	NT_187142	ATA	2	6	2244	2249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202360
53	NT_187142	GAA	2	6	2285	2290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202360
54	NT_187142	AAG	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202360
55	NT_187142	TAT	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202360
56	NT_187142	GCTTAA	2	12	2362	2373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426202360
57	NT_187142	TGATGT	2	12	2380	2391	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	426202360
58	NT_187142	TTTAAA	2	12	2403	2414	50 %	50 %	0 %	0 %	426202360
59	NT_187142	AT	4	8	2428	2435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187142	TTAA	2	8	2502	2509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187142	AGC	2	6	2516	2521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187142	AAT	3	9	2595	2603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187142	GGT	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187142	AAT	2	6	2715	2720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187142	CAT	2	6	2827	2832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187142	TGG	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187142	TTAT	2	8	2920	2927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187142	TAT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187142	ACA	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187142	TTA	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187142	AAG	2	6	3139	3144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187142	ATA	2	6	3302	3307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187142	TAT	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187142	ACT	2	6	3383	3388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187142	TATACT	2	12	3414	3425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NT_187142	TAT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187142	TA	3	6	3489	3494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187142	AAT	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187142	AAG	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187142	ACTTA	2	10	3584	3593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NT_187142	TTAT	2	8	3597	3604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187142	TAA	3	9	3606	3614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187142	TTA	2	6	3632	3637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187142	AT	3	6	3683	3688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187142	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187142	AGTTC	2	10	3825	3834	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NT_187142	TAAG	2	8	3920	3927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187142	AGAT	2	8	3949	3956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187142	TAG	2	6	4083	4088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187142	ATTT	2	8	4177	4184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187142	AGT	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187142	AGA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187142	AAT	2	6	4267	4272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187142	TTA	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187142	T	6	6	4359	4364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187142	ATTA	2	8	4412	4419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187142	ACA	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187142	TTCT	2	8	4454	4461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NT_187142	TATT	2	8	4536	4543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187142	AG	3	6	4623	4628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187142	A	7	7	4635	4641	100 %	0 %	0 %	0 %	426202361
102	NT_187142	AAT	3	9	4661	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202361
103	NT_187142	TTTA	2	8	4673	4680	25 %	75 %	0 %	0 %	426202361
104	NT_187142	TAA	2	6	4697	4702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202361
105	NT_187142	GTAA	2	8	4770	4777	50 %	25 %	25 %	0 %	426202361
106	NT_187142	GCA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202361
107	NT_187142	AAG	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202361
108	NT_187142	GAAA	2	8	4867	4874	75 %	0 %	25 %	0 %	426202361
109	NT_187142	ATG	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202361
110	NT_187142	GTA	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202361
111	NT_187142	ACA	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202361
112	NT_187142	TAAA	2	8	5053	5060	75 %	25 %	0 %	0 %	426202361
113	NT_187142	A	6	6	5088	5093	100 %	0 %	0 %	0 %	426202361
114	NT_187142	TGA	3	9	5102	5110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202361
115	NT_187142	A	7	7	5114	5120	100 %	0 %	0 %	0 %	426202361
116	NT_187142	AAAG	2	8	5126	5133	75 %	0 %	25 %	0 %	426202361
117	NT_187142	ATA	2	6	5134	5139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202361
118	NT_187142	TAAC	2	8	5279	5286	50 %	25 %	0 %	25 %	426202361
119	NT_187142	AATA	2	8	5292	5299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187142	AGT	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187142	TAT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187142	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187142	TA	3	6	5431	5436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187142	ATAA	2	8	5465	5472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187142	AAT	2	6	5513	5518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187142	TG	3	6	5543	5548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187142	A	6	6	5567	5572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187142	AAT	2	6	5579	5584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187142	T	7	7	5630	5636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187142	A	7	7	5657	5663	100 %	0 %	0 %	0 %	426202362
131	NT_187142	AAT	3	9	5683	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202362
132	NT_187142	TTTA	2	8	5695	5702	25 %	75 %	0 %	0 %	426202362
133	NT_187142	TAA	2	6	5719	5724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202362
134	NT_187142	GCA	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202362
135	NT_187142	AAG	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202362
136	NT_187142	AGA	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202362
137	NT_187142	TTGC	2	8	5945	5952	0 %	50 %	25 %	25 %	426202362
138	NT_187142	CT	3	6	6017	6022	0 %	50 %	0 %	50 %	426202362
139	NT_187142	CTG	2	6	6045	6050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202362
140	NT_187142	GTG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202362
141	NT_187142	AAAT	2	8	6076	6083	75 %	25 %	0 %	0 %	426202362
142	NT_187142	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202362
143	NT_187142	TGA	2	6	6124	6129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202362
144	NT_187142	AGC	2	6	6139	6144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202362
145	NT_187142	CTA	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202362
146	NT_187142	CAG	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202362
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152	NT_187142	AAG	2	6	6395	6400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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286	NT_187142	TAA	2	6	11159	11164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NT_187142	AAG	2	6	11278	11283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NT_187142	TGA	2	6	11306	11311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NT_187142	TTA	2	6	11323	11328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NT_187142	AAAG	2	8	11330	11337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
291	NT_187142	ATA	2	6	11359	11364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NT_187142	ATA	2	6	11409	11414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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322	NT_187142	AAG	2	6	12811	12816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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325	NT_187142	TAA	2	6	12984	12989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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410	NT_187142	AAG	2	6	16023	16028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
411	NT_187142	TTA	2	6	16076	16081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NT_187142	GTA	2	6	16082	16087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
413	NT_187142	GCA	2	6	16246	16251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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417	NT_187142	AGC	2	6	16389	16394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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419	NT_187142	CAA	2	6	16447	16452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NT_187142	GCT	2	6	16468	16473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NT_187142	AGC	2	6	16488	16493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NT_187142	GTA	2	6	16503	16508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NT_187142	AAT	2	6	16515	16520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NT_187142	TAG	2	6	16537	16542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
425	NT_187142	G	7	7	16554	16560	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
426	NT_187142	CAGCAT	2	12	16589	16600	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NT_187142	AATT	2	8	16631	16638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NT_187142	TAT	2	6	16770	16775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NT_187142	TAG	2	6	16866	16871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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